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1930 民國19年
(日本昭和5年)
「台灣總督府樂生院」正式成立,任命台灣總督府癩養所醫長上川豐為樂生院首任院長。為台灣第一所也是唯一公立漢生病防治醫院。
1945 民國34年 光復後,前台灣省衛生局接收樂生院,更名為「台灣省立樂生療養院」,癩患遽增至四百餘人,陸續增建29棟病舍。
1952 民國41年 1.樂生療養院開始引進當時國際上使用之麻風效藥「滴滴實」(Diamino-Diphenyl-Sulfone,DDS),開啟漢生病得以根治之可能性,將台灣漢生病防治成效向前推進一大步。
2.基督教信徒籌建「聖望禮拜堂」,正式落成啟用。
1954 民國43年 1.實行病患分區自治制度,奠定院務管理基礎。
2.佛教信徒籌建「棲蓮精舍」,正式落成啟用。
3.患者五人病癒出院,為患者正式出院之始。
1956 民國45年 台北縣鄉鎮長改選,樂生療養院患者於院內大禮堂首次行使投票權。
1957 民國46年 1.國軍退除役官兵輔導委員會主任委員 蔣經國 先生蒞臨本院參觀。
2.退輔會陸續興建病舍,收容榮民癩患,病舍增至42棟。
1959 民國48年 「台灣省漢生病防治委員會」成立,正式將全台漢生病防治任務交付樂生療養院。
1960 民國49年 開辦全台漢生病巡迴檢診,並將全台各案納入管制系統。
民國50年代 收容癩患人數達最高計1,118人。
1962 民國51年 蔣 宋美齡 夫人率中華婦女反共抗俄聯合會會員抵本院慰問病患。
1975 民國64年 省府謝主席重視癩漢生病患者之收容,奉旨示陸續增建病舍60棟,970張病床。
1976 民國65年 訂定「癩漢生病防治十年計畫」,全面防治教育宣導。
1985 民國75年 訂定「癩漢生病防治十年計畫」,將漢生病防治重點由「治療」推向「預防」,並以三十年後完成漢生病防治工作,結束樂生療養院之運作為遠程目標。
1999 民國88年

配合政府精省改隸為「行政院衛生署樂生療養院」,並開始執行「整建計畫」。

2001 民國90年 行政院院長張俊雄蒞新莊市公所,聽取捷運系統簡報,並指示衛生署協助本院拆遷整建事宜。
2002 民國91年 1.增設「迴龍門診部」提供對外門診服務,積極走入社區服務,位醫院轉型準備。
2.內政部營建署完成本院新建新醫療大樓發包工程。
3.因捷運徵收拆遷病舍,目前病舍數31棟 (包括組合屋6棟)。
2004 民國93年 國際麻風五十週年,結合希望之翼在本院擴大舉辦向「抗癩鬥士致敬」,邀請陳總統水扁蒞臨致詞。
2005 民國94年 1.因台灣公衛提升、醫學科技進步、收容政策之調整及院民多年邁漸凋零等因素,現今收容之病患計338人(94.04.30)。
2.呂副總統蒞臨本院視察。
3.行政院謝院長長廷、衛生署侯署長勝茂蒞臨本院視察。
2006 民國95年

1. 衛生署侯署長勝茂到院關心院民。
2. 新莊市龍福里、樹林市及龜山鄉民遞交連署書,要求本院早日展開急性醫療作業,以嘉惠社區民眾。
3. 實施「清淨家園全民運動計畫」
4. 慶祝 76 週年院慶暨迴龍院區啟用典禮